Поднял недавно пару машин на Linux и FreeBSD, и прям сразу полез пробежаться по базовым вещам, которые обычно забываешь. Вот что обычно смотрю, может кому пригодится:

1. Запущенные сервисы — systemctl или rc.d легко покажут, что стартует автоматом. Часто там дохрена всего лишнего, что грузит систему и открывает поверхности для проблем.

2. Проверка прав на каталоги и файлы /etc, /var и домашний каталог — иногда случаются лишние права или наоборот, что ломает работу софта.

3. Сетевые настройки — интерфейсы, firewall (iptables или pf) и роутинг. Без контроля тут можно словить неудачу с сетью или безопасность просесть.

4. Логи — quick glance на /var/log/ (syslog, messages, dmesg) реально выдают подсказки о скрытых проблемах. Не игнорирую.

5. Обновления — apt, pkg, или ports — убедиться, что все в актуальной версии. Иногда дистры забывают сами обновиться.

6. Swap и загрузка памяти — по памяти выдаёт ли система предупреждения, а swap не слишком ли мал и не слишком ли активно используется.

7. Внимательно к cron/jobs — не должно стоять подозрительных задач, которые нагружают систему.

Как у вас выглядит стартовый чек-лист? Может кого-то что-то другое на первых порах удивляло или спасало?