Если только втыкаешь в тему уязвимостей, то проще всего начать с базовых вещей — проверка входных данных, настройка прав доступа и обновления. Часто именно забытые патчи, слабые пароли и не фильтрованный ввод дают основное поле для атак. Лично я всегда запускаю сканеры на SQL-инъекции и XSS, но не просто ради автоматического отчёта — важно понимать, где именно и почему система «провисает». После этого анализирую логи и смотрю, что именно пропускает приложение — это помогает понять слабые места глубже, чем просто «нашёл баг — устранил».