Работая с Linux и FreeBSD, не раз видел, как люди наступают на одни и те же грабли. Например, начинающие любят запускать команды с sudo без понимания, что делают — потом удивляются, почему система слетела или файлы исчезли. Ещё классика — забивают на бэкапы, а потом теряют кучу времени на восстановление.

Другой момент — попытка влезть в конфиги без чтения документации. Часто меняется что-то в /etc, а после перезагрузки система либо не загружается, либо сервисы работают криво. Тут лучше сначала понять, что именно меняешь, и иметь под рукой live USB.

Сравнивая Linux и BSD, скажу, что BSD чуть более консервативен в обновлениях, и тут ошибка — пытаться лепить всё, что нравится, вместо того чтобы идти проверенным путём. В Linux с этим проще, но там тоже своя растерянность из-за кучи дистров и пакетов.

Короче, если уж работать с этими системами, то лучше привыкнуть проверять каждую команду (man, help, форумы), делать бэкапы конфигов и не пытаться «всё починить» одним махом. Кто ещё подкинет свои топ ошибок?