Вас хотели обмануть чтобы научиться _хорошо_ программировать на perl нужно быть либо психом-гением либо потратить на это _очень_ много времени (например в perl'е очень часто используются непоятные на первый и второй взгляд конструкции навроде for(@mas)print $_; или print 'true' if($flag); ) но не смотря на свою уникальность и многофункциональность perl постепенно уходит в прошлое (на данный момент его "защищают" только истинные ценители и люди помнящие времена когда perl был вездесущ )
На данные момент активно развивается и смещает со своего места perl относительно новый язык - python, если нужно писать сложные, но функциональные скрипты под *nix, да так чтобы можно было другим показать - тогда начинай учить питон (благо он достаточно прост в освоении)
Научиться писать скрипты на bash'у (shell) не так уж и долго если задаться такой целью, поэтому смысла учить shell _или_ что-то иное нет.

П.С. Для того чтобы изучить ОС - нужно ее настраивать. Читать статьи, гуглить, ковыряться.