Мне кажеться если ты уже всетаки определился с железом то самый лучший вариант
Ставить ОС из семейства линухов
Лично я Юзал для этих целей мандриву2008, остался даволен
От себя:
Если для web советую ставить, винду. т.к. поддержка всего. Включая .net который сейчас так популярен.
Если для файл хранилища или какие либо вычислительные ресурсы типа рендеринга, то советую фряху.