Если только начинаешь, проще всего взять Ubuntu или Mint — там всё более-менее понятно и много помощи в сети. FreeBSD классный для серверов и тех, кто хочет разобраться в сетях и безопасности, но он для новичка может показаться сложным. В Linux больше драйверов и программ, да и интерфейс привычнее, так что рекомендую сначала с него стартовать.