Права файлов реально влияют на безопасность и нормальную работу CMS. Обычно достаточно проверить через SSH командой ls -l, чтоб убедиться, что важные файлы, типа конфигов, не имеют прав на запись у всех. Пошаманить права 644 для файлов и 755 для папок — классика, и проверить владельца, чтобы совпадал с веб-сервером. Это базово, но важно.