Сам заметил, что у Яндекса с индексацией новых тем бывает задержка, особенно если форум большой и много страниц. Иногда помогает просто подождать — рано или поздно роботы дойдут. Ещё важно, чтоб ссылки на новые темы были доступны с главных разделов, иначе их реально может долго не увидеть поисковик.