В целом, тут многое зависит от конкретной машины. Иногда можно всю автозагрузку почистить — а толку почти нет, потому что диск уже мозг выносит или драйверы криво играют. С SSD ситуация лучше, но и там бывают косяки с обновлениями или биосом. Вирусы, безусловно, тоже могут тормозить, но не всегда и не у всех. Так что универсального рецепта нет, нужно постепенно методично проверять и не ждать чуда сразу.