Сразу по делу — не надо просто ставить AntiDDos и надеяться на чудо. Прежде чем включать любую антиддос-систему, надо понять, с чем имеешь дело. Первое — убедиться, что проблема именно в ддосе, а не в глюках сети или в железе. Проверяешь нагрузку на трафик, смотришь логи, пингуешь сервер — если пинг высокий и трафик скачет, скорее всего атака.
Дальше стоит понять тип ддоса или паттерны поведения — объемный, медленный, сложный многовекторный. Разные антиддосы по-разному с этим работают. Если с этим совсем туго, имеет смысл сначала смотреть на простые фильтры и лимиты, а не сразу лезть в сложные системы.