Вот в том то вся и разница:
1. Если вы пишите программу для дальнейших перепродаж, вы пишите теряя свое время и потом продаете софтину по каких 50у.е.
2. Другое дело, если вы пишите софтину под заказ, вам уже оплачивают затраченное вами время по вами установленным тарифам и заниматься дальнейшими перепродажами просто не этично и не честно.

Люди заказывают софт индивидуальный по многим причинам, но все рассчитывают на то, что он по рукам не пойдет. Это в первую очередь влияет на безопасность в использовании. Кто хочет публик софт, хватает магазинов с таким же софтом, что люд заказывает.

Хорошо хоть, что честно предупредили, что вы такими делами занимаетесь.

С законами об авторских правах я знаком, есть такое положение, что права за автором остаются, но для этого и есть оговорка в контракте, что права переходят заказчику - и это всегда подразумевается, если заказ индивидуальный.

Могу вам по цифрам расписать, в чем разница:
Делаете под заказ:
Вы затратили на работу 2 часа, за нее вам к примеру заплатили 100у.е.
Вы конечно перепродавая никогда не продадите это же ПО за 100у.е., но вам и зачем, за работу вы же уже получили, ну и давай его по 10у.е. отдавать, все же прибыль.

Делаете сами для дальнейших продаж:
Затратили те же 2 часа - но вам еще никто не заплатил.
Вам нужно теперь искать клиентов, что бы набрать эти 100у.е., которые в первом случае получили сразу, а продать врядли его сможете дороже 10-20у.е. за копию

Вот и смотрите, в чем разница.
В первом случае вам уже оплатили и вы сполна получили за труды, во втором написать - еще не значит заработать и вы тратите время на продажи.

Так почему вам не быть честным и не брать непосредственно за свою работу, а не перепродавать чужие идеи?
Ведь вы только исполнитель, а авторские права на ПО в первую очередь нужно давать именно тому, что придумал нужный функционал, который вам дал в ТЗ.