Нет, тебя обманули. Почитай про формат Pe и сигнатуру Mz которую ты собрался менять.
Прога не запустится - факт, но привести её в нормальное состояние не составит труда.

Читай книгу Брюса Шнаера "Прикладная криптография". Минимум.