Cron – любим новичками, быстро настраивается, но слишком заметен из-за логов и интервалов. Systemd чуть сложнее, зато может безотказно перезапускать службу и маскироваться под нормальный процесс. SSH-ключи вообще тихие, не требуют лишних процессов, но зависят от файлов и прав. В общем, выбор зависит от прав и задачи: cron – просто, systemd – надёжно, SSH – скрытно.